水泳部は大会に向けて校内の屋内プール(5～10月)、校外プール(11～4月)を使い練習しています。監督・コーチはOBの大学生です。出場する主な大会としては、6月に学習院中等科との対抗戦、中学都大会、高校都大会、８月に新宿区大会、9月に中学学年別大会、高校新人戦などがあります。9月に開催される高校新人戦で高校2年生が引退します。また、3月の下旬に4泊5日の合宿があり、そこで次年度大会に向け、泳力の向上を図ります。